Mata kuliah Ekologi Perairan ini membahas tentang perairan air darat (inland water), daur hidrologi, organisme di ekosistem akuatik, metode sampling di ekosistem lentik dan lotik, siklus nutrien, metode analisis kualitatif plankton dan invertebrata benthik.  Perkuliahan menggunakan pendekatan Student Center Learning (SCL), dengan model Cooperative Learning, dan metode ceramah, diskusi, tanya jawab.